10X genomics 单细胞测序,动物细胞的培养、流式细胞术对细胞的各种参数分析等实验必须基于单细胞的基础上,根据不同实体组织成份的特点可选择不同的消化组织分散细胞的方法,以达到单细胞产量高、细胞损伤小的目的。
极客基因努力摸索技术方法,针对不同组织进行处理时,尽可能采用对细胞损伤小、产率较高的单细胞悬液制备方法,最大限度地保持细胞原有的特性。
如小鼠脾脏、肝脏、心脏、肺脏、脑组织、肿瘤组织、人肿瘤组织、神经、皮肤组织等。
需要,一般胰蛋白酶最常用,浓度一般0.25%-5%,37℃消化时间一般1-5min,用血清终止。
需要综合考虑癌组织的形状、面积等,注意不要混入坏死部分和未癌变的正常组织,要肿瘤细胞数量较多的组织,材料采集大小约为1cm3(0.5-1.0克)。间质较多的组织,材料采集大小约为3cm3(1.0-3.0克)。微小样本应保证有效癌变组织大于0.3克。
影响细胞计数准确性的一个重要因素是细胞储液的浓度。研究发现,细胞储液的浓度在700-1200个细胞/µl的范围内是最理想的。超出这个最佳范围,可能导致细胞计数的结果不可靠。如果样本不在这个范围内,建议相应地调整细胞储液的浓度。