Xenium技术直接在真实组织环境中 对细胞进行原位分析。直接检测并保留组织切片中数百个RNA靶点的细胞定位,无需常规测序技术辅助。Xenium原位分析技术使用针对靶点基因特异性的可环化探针和目标RNA杂交,再通过环状探针原位滚环扩增,扩增可供荧光标记探针杂交的基因特异性空间标签序列。在Xenium分析仪上进行多轮荧光标记探针的杂交,每一轮杂交反应中,荧光标记 探针和基因特异性空间标签序列杂交,通过高分辨率显微镜扫描图像,检测每个荧光探针的位置,然后将荧光探针移除。连续几轮的荧光探针杂交、成像和移除会形成独特的荧光信号组合特征条形码,揭示组织中每个细胞内每个位置的RNA身份信息。
10X Genomic官方效果展示图
Xenium分析仪在每次运行时可分析两张Xenium载玻片。每张Xenium载玻片上的可成像区域为10.5× 22.5 mm,其上可放置组织切片,因此每张载玻片上可包含多张组织切片。
每次Xenium运行最多可容纳两张Xenium载玻片,一周内最多可开展三次运行。因此,目前的分析流程可在一周内完成多达六张Xenium载玻片的运行。
Xenium图像是在仪器上实时处理的。数据可转移到仪器外,用免费的Xenium Explorer桌面软件进行可视化处理,以便进一步分析。此外,Xenium数据采用开放文件格式,与各种开源软件工具兼容。